Вебинар_микробиота_кишечника_академия_юнипроф

1. Микробиота кишечника как основа здоровья человека

Ворошилина Екатерина Сергеевна
д.м.н., профессор
зав.кафедрой медицинской микробиологии и клинической лабораторной
диагностики ФГБОУ ВО УГМУ МЗ РФ,
зав.лабораторным отделением МЦ «Гармония»
1

2.

Отношения микробиома и человека носят мутуалистический характер
60% всех бактерий находится в кишечнике
Масса микробиоты ЖКТ взрослого человека – 200 u
Численность кишечных микроорганизмов 10¹1-10¹2 клеток
Численность генов микробиома на 3 порядка выше, чем
собственных генов организма человека
Сформировалось представление о микробиоте как об отдельном органе
2

3. «Классические» функции кишечной микробиоты

Питательные
вещества
Патогенные
микроорганизмы
Метаболиты
Слизистая оболочка
Микробиота
1
2
3
1
22
Метаболическая
роль
Барьерная функция Иммуностимуляция
3
4
Клетки кишечника
4 Поддержание
целостности
слизистой оболочки
3

4.

5. Кто управляет нашим настроением? Микробиота кишечника или головной мозг?

5

6. Качественный и количественный состав микробиоты меняется на протяжении ЖКТ

https://doi.org/10.1007/s00428-017-2277-x
6

7. Пристеночная vs полостная микробиота

Особенности пристеночной
микробиоты
• Количество – 105 - 106 КОЕ на мл
• Условия аэробные
• Видовое разнообразие – скудное
• Доминируют факультативные
анаэробы
Наиболее представленные
филумы Pseudomonadota, Bacillota
doi: 10.1016/j.chom.2017.03.010.
7

8. Пристеночная микробиота вероятно является резервуаром и источником аэробной микробиоты, ассоциированной с воспалительными

заболеваниями кишечника
•https://doi.org/10.1080/19490976.2014.1000080
8

9. Дисбактериоз/ дисбиоз кишечника: «камень преткновения» в современной медицине

Любимый диагноз российских врачей
Нет в кодах МКБ
Рынок пробиотиков огромен
Эффективность обсуждается
Накоплен массив данных о связи
микробиома кишечника и здоровья
Запрос от врачей и пациентов на
доступную диагностику
9

10. Human Microbiome Project микробиота кишечника

Авторы: Ottman, Smidt, de Vos and Belzer
10

11. Таксономический состав микробиоты кишечника

В рамке приведены примеры
бактерий, принадлежащих к филумам
Bacillota и Bacteroidota, которые
составляют более 90% кишечной
микробиоты.
Rinninella E, Raoul P, Cintoni M, Franceschi F, Miggiano GAD,
Gasbarrini A, Mele MC. What is the Healthy Gut Microbiota
Composition? A Changing Ecosystem across Age, Environment, Diet,
and Diseases. Microorganisms. 2019 Jan 10;7(1):14. doi:
10.3390/microorganisms7010014. PMID: 30634578; PMCID:
PMC6351938.
11

12. Основные филумы, образующие микробиоту толстого кишечника человека

Филум Bacillota :
Eubacteria, Lactobacillus, Clostridium,
Lachnobacterium, Roseburia, Faecalibacteria,
Blautia, Dorea, Bacillus, Mycoplasma,
Streptococcus, Enterococcus, Leuconostoc,
Staphylococcus spp
Филум Actinomycetota :
Bifidobacterium, Propionibacterium,
Corynebacterium, Frankia, Arthrobacter,
Micrococcus, Mycobacterium
Филум Bacteroidota:
Bacteroidia (Bacteroides, Prevotella,
Porphyromonas, Alistipes spp.),
Flavobacteriia (Flavobacterium sp.),
Cytophagia (Carnocytophaga, Odoribacter),
Sphingobacteriia (Sphingobacterium sp.)
Филум Pseudomonadota :
Enterobacterales, Vibrionaceae,
Pseudomonadaceae
12

13. Ключевые функции основных филумов микробиоты толстого кишечника

Bacillota
• метаболизм сложных углеводов, в том числе нерастворимых
полисахаридов
• метаболизм белка, не утилизированного в верхних отделах ЖКТ
Bacteroidota
• участвуют в деградации полисахаридов, метаболизме желчных
кислот, холина, белков и аминокислот,
• продуцируют метаболиты-медиаторы
Actinomycetota
• сахаролитики, осуществляют гидролиз сложных углеводов
• Участвуют в формировании гликокаликса – фактора
колонизационной резистентности кишечной слизистой
Pseudomonadota
• участвуют в выработке и поддержании как локального, так и
системного гуморального иммунитета
• могут становиться причинами патологического процесса
13

14. Дополнительные (субдоминантные) филумы в составе микробиоты толстого кишечника

Phylum
Fusobacteriota
• семейства Fusobacteriaceae и Leptotrichiaceae
• Fusobacterium nucleatum – в норме отсутствует!
F.nucleatum создает провоспалительное микроокружение
Может являться ранним маркером канцерогенеза.
Phylum
Verrucomicrobiota
• 18 родов, в том числе Akkermansia (A.muciniphila) и Prosthecobacter sp.,
утилизирующие различные сахара и гликопротеиды (муцин)
• A.muciniphila улучшает целостность кишечного барьера, вырабатывает КЦЖК
• Высокое содержание Akkermansia соотносится с более высокой чувствительностью
к инсулину и лучшим метаболизмом
Phylum
Euryarchaeota
• Присутствие некультивируемых архей – продуцентов метана, в том числе рода
Methanobrevibacter (M. smithii), обеспечивает утилизацию водорода,
образующегося при гидролизе углеводов;
• M. smithii утилизирует водород и углекислый газ с образованием метана, что
стимулирует процесс ферментации пищи сахаролитическими бактериями.
14

15. Плод в утробе матери стерилен

• Kennedy KM, de Goffau MC et
al. Questioning the fetal
microbiome illustrates pitfalls of
low-biomass microbial studies.
Nature. 2023
Jan;613(7945):639-649. doi:
10.1038/s41586-022-05546-8.
Epub 2023 Jan 25. PMID:
36697862.
15

16. Основные источники и этапы становления микробиома новорожденного

16

17. Мнение экспертов

Ключевые факторы, определяющие формирование
«здорового» микробиома ребенка:
Срок гестации на момент
рождения
Способ родоразрешения
Раннее прикладывание к
груди
Способ вскармливания
Введение прикорма
Антибиотикотерапия
Состояние микробиоты
матери?
Географическое положение?
Гигиенические навыки?
Домашние животные?
Контакты вне семьи?
17

18. Первые обитатели кишечника после рождения

Естественные
роды
Кесарево
сечение
Вагинальная
микробиота
Lactobacillus spp.
Микробиота
персонала и
операционной
Staphylococcus
spp.,
Streptococcus
spp., или
Propionibacteria
Tamburini, S., Shen, N., Wu, H. et al. The microbiome in early life: implications for
health outcomes. Nat Med 22, 713–722 (2016). https://doi.org/10.1038/nm.4142
18

19. Ключевые тенденции в формировании микробиоты новорожденного

• Микробиота кишечника новорожденного
формируется в две фазы, переломным моментом
является введение прикорма
• Первая фаза – период грудного
вскармливания
• Вторая фаза – введение твердой пищи
• Состав микробиоты младенца стремиться в
сторону таксономического и функционального
состава материнской микробиоты.
Vallès Y, Artacho A, Pascual-García A, Ferrús ML, Gosalbes MJ, Abellán JJ, et al. (2014) Microbial Succession in the Gut: Directional Trends of Taxonomic
and Functional Change in a Birth Cohort of Spanish Infants. PLoS Genet 10(6): e1004406. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004406
19

20. Срок гестации к моменту родоразрешения влияет на разнообразие микробиоты кишечника у новорожденного

• Микробиота кишечника экстремально
недоношенных детей радикально отличается от
микробиоты детей, родившихся в срок, и
умеренно недоношенных.
• Индивидуальные особенности микробиоты
кишечника недоношенных детей определяют
спектр выявляемых у них патологий.
• Наибольшее влияние на состав микробиоты
кишечника недоношенных детей оказывает
микробиота кишечника матери.
HENNI HILTUNEN: Preterm infant growth – with a focus on early nutrition and initial gut microbiota
Doctoral Dissertation, 2022
20

21. Этапы формирование микробиоты кишечника у недоношенных детей

• Фаза 1 - доминирование Staphylococcus spp.
• максимально выражено между 25 и 30 неделями гестации
• завершалось к 35 неделе
• Фаза 2 - преобладание Enterococcus spp.
• максимальным в 30 недель
• заканчивалось к 35 неделе
• Фаза 3 - преобладание Enterobacteriaceae (преимущественно Enterobacter spp.)
• Пик на 35 недель гестации
• снижение к сроку нормального родоразрешения – 40 неделям.
• Фаза 4 - преобладание Bifidobacterium spp.
• характерна для доношенных детей.
Вероятно, степень зрелости организма новорожденного, зависящая от срока гестации при рождении,
является ключевым фактором, определяющим тип доминирующей группы кишечных бактерий.
https://doi.org/10.1038/s41598-018-20827-x
21

22. Микробиота кишечника у детей, рожденных путем кесарева сечения, имеет особенности

У детей после кесарева снижено
количество Bacteroides (особенно в
случае плановой операции)
Попытки «обсеменить» новорожденного
вагинальным секретом сразу после
кесарева позволили приблизить его
микробиом к естественному
Med 2021 2951-964.e5DOI: (10.1016/j.medj.2021.05.003)
Med 2021 2951-964.e5 DOI: (10.1016/j.medj.2021.05.003
22

23. Раннее прикладывание к груди

Олигосахариды грудного молока
Младенческие штаммы
бифидобактрий
Продуценты КЖК
Влияние на рецепторы клеток
иммунной системы
Снижение воспалительных
процессов в кишечника
Повышение защитного барьера
кишечника
Грудное молоко кормит не только малыша,
но и микробиоту его кишечника!
2022 Jun 21;10:886627.
doi: 10.3389/fped.2022.886627. eCollection 2022.
23
Metagenomics Approaches to Investigate the Neonatal Gut Microbiome

24. Своевременное введение разнообразного прикорма – залог разнообразия микробиоты кишечника

Клетчатка, ПВ, растительный белок
злаковых, животный белок
Ферментируемые субстраты для бактерий
Увеличение разнообразия микробиома
↑доли бактероидов
↑ концентрации короткоцепочечных
жирных кислот
24

25. Применение антибиотиков наносит ущерб микробиоте кишечника и долгосрочно влияет на здоровье ребенка

• АБ в неонатальный период
• Снижается количество и разнообразие бифидобактерий в возрасте до 2-х лет.
• Замедляется рост и набор веса у мальчиков .
• АБ в младенчестве и детстве (до 6 лет жизни)
• Способствуют увеличению избыточной массы тела и развитию ожирения как у
мальчиков, так и у девочек.
Uzan-Yulzari A, Turta O et al,Nat Commun. 2021
doi: 10.1038/s41467-020-20495-4. PMID: 33500411
25

26. Дисбиоз кишечника у детей

Атопии в течение первого года жизни
http://dx.doi.org/10.1136/gut.2006.100164)
Алергические заболеваний в детском
возрасте
https://doi.org/10.1067/mai.2001.118130]].
Кишечная микробиота является
основным источником
уропатогенной флоры
. doi: 10.3389/fcimb.2022.1059825.
Воспалительные заболевания
кишечника в более старшем возрасте
doi: 10.1016/j.chom.2014.02.005
Доказана роль дисбиоза кишечной
микробиоты в формировании
сахарного диабета 2 типа
doi: 10.3390/nu14010166. PMID: 35011044
Ожирение в подростковом возрасте
doi: 10.3748/wjg.v27.i25.3837
Аутизм и дисбаланс кишечной
микробиоты
Chen, X; D'Souza, R; Hong, ST (2013)
26

27. Механизмы, вовлеченные в связь между микробиотой и развитием и функционированием мозга: 1.Баланс цитокинов и активация

микроглии (иммунный путь)
2. Кортизол (эндокринный путь)
3. Блуждающий нерв и энтеральная нервная система (нервный путь)

28. Значимые бактерии - продуценты нейромедиаторов

Медиатор
Основные эффекты
Бактерии продуценты
ГАМК
обладает тормозящим эффектом,
отвечает за уравновешенность
Lactobacillus spp. и
Bifidobacterium spp.
Норадреналин
нейромедиатор бодрствования,
принятия быстрых решений
Escherichia spp., Bacillus spp. и
Saccharomyces spp.
Дофамин
гормон мотивации и поведения
Bacillus spp.
Ацетилхолин
обучение и формирование
памяти
Lactobacillus spp
Серотонин
определяет перистальтику ЖКТ,
вазоконстрикцию
Candida spp., Streptococcus spp.,
Escherichia spp. и Enterococcus
spp
Yao Y, Cai X, Ye Y, Wang F, Chen F and Zheng C (2021) The Role of Microbiota in Infant
Health: From Early Life to Adulthood. Front. Immunol. 12:708472. doi:

29. Отдельные микробные метаболиты в просвете тонкого кишечника регулируют активность блуждающего нерва посредством

рецепторно-опосредованной
сигнализации

30. Микробиом кишечника стимулирует активность блуждающего нерва

• Активность афферентных волокон блуждающего нерва различалась у «диких» мышей и «стерильных»
мышей
• Активность афферентных волокон блуждающего нерва снижалась при введении антибиотиков в
полость кишки «диким» мышам
• Активность афферентных волокон блуждающего нерва возрастала при введении кишечной
микробиоты «стерильных» мышам

31. Антибиотики и активность блуждающего нерва

Снижение активности вагуса
на фоне антибиотикотерапии
Восстановление активности вагуса
при введении содержимого тонкой
кишки и слепой кишки

32. 931 микробный метаболит был выделен из содержимого тонкой и слепой кишки

Микробиом-зависимые
желчные кислоты
КЦЖК
(коротко-цепочечные
жирные кислоты)
3-индоксилсульфат
Отдельные микробные метаболиты просвета усиливают активность
афферентного нерва блуждающего нерва с различной кинетикой
ответа

33. Доказательства связи микробиоты и поведения

• У животных без микробов наблюдали:
• нарушения социального поведения.
• изменения в многочисленных нейротрансмиттерах
и их рецепторах в различных областях мозга.
• нарушения нейрогенеза и структурные и
функциональные изменения в миндалевидном
теле.
• префронтальная кортикальная гипермиелинизация.
Cenit MC, Sanz Y, CodoñerFranch P. Influence of gut
microbiota on
neuropsychiatric
disorders. World J
Gastroenterol 2017; 23(30):
5486-5498 [PMID:
PMC5558112 DOI:
10.3748/wjg.v23.i30.5486]
• Пробиотические препараты способствовали
снижению тревожно-подобного и
депрессивно-подобного поведения у
животных.

34. Особенности микробиоты толстого кишечника у детей с расстройствами аутистического спектра

Bacteroides,
Parabacteroides,
Clostridium,
Faecalibacterium,
Phascolarctobacteriu
m
РАЗНООБРАЗИЕ
МИКРОБИОТЫ
Bifidobacterium
Akkermancia
Anaerostipes,
Blautia,
Veillonella,
Dialister,
Streptococcus
doi: 10.3390/nu12030792
doi: 10.1007/s10803-021-05002-y

35. Методы лабораторной оценки микробиоты кишечника

35

36. Где, что и как исследуем?

Желудок
Гистология биопсийного
материала
Helicobacter pylori
Тонкая
кишка
Водороднометановый
дыхательный тест
СИБР
Фекалии
Дисбиоз толстого
кишечника
Толстая
кишка
36

37. Возможности лабораторной оценки микробиоты толстого кишечника в настоящее время

• Микроскопический метод – копрограмма
• Культуральный метод – посев кала на дисбактериоз кишечника
• Метаболомные исследования
• Метод газо-жидкостной хроматографии
• Методом газовой хромато-масс-спектрометрии микробных не для детей
маркеров
• Молекулярно-генетические методы
• Исследование состояния кишечника методом NGS
• ПЦР с детекцией результатов в реальном времени
• Тест ЭнтерофлорДети – для детей от 0 до 14 лет
37

38. Преимущества ПЦР в реальном времени

Гибкие условия сбора и хранения биоматериала
Высокая чувствительность и специфичность
Высокая скорость получения результата – 1-2 рабочих дня
Выявление всех, в том числе трудно культивируемых
представителей микробиоты
Количественная оценка
Определение доминирующих групп микроорганизмов
Выявление генов токсигенности и устойчивости к антибиотикам
38

39. Тест Колонофлор – решение для взрослых и подростков от 14 лет

Нормобиота:
• Бифидобактерии
• Лактобациллы
• Escherichia coli
• Faecalibacterium prausnitzii
• Bacteroides spp.
• Akkermansia Muchiniphila
• Roseburia inulinivorans
• Eubacterim rectale
• Prevotella spp.
• Ruminococcos spp.
• Blautia spp.
• Methanobrevibacter smithii
• Methanosphaers stadmanae
39

40. Условно-патогенные и патогенные бактерии в тесте Колонофлор

• Грамотрицательные
энтеробактерии
• Klebsiella pneumoniae/oxytoca
• Citrobacter spp./Enterobacter spp.
• Proteus spp.
• Escherichia coli enteropathogenic
• Грамположительные бактерии
• Staphylococcus aureus
• Streptococcus spp.
• Спорообразующие бактерии
• Clostridium difficile
• Clostridium perfringens
• Патогенные энтеробактерии
• Shigella spp.
• Salmonella spp
• Грибы
• Candida spp.
40

41. Микробные маркеры канцерогенеза

• Fusobacterium nucleatum – в норме отсутствует!
• F.nucleatum создает провоспалительное микроокружение
• Может являться ранним маркером канцерогенеза.
• При обнаружении рекомендовано дополнительное
инструментальное обследование для исключения
новообразований кишечника.
• Parvimonas micra - в норме отсутствует!
• Является фактором, способствующим развитию канцерогенеза в
толстом кишечнике.
• Предположительно является одним из ранних маркеров
канцерогенеза в толстом кишечнике.
• При обнаружении рекомендовано дополнительное
инструментальное обследование для исключения
новообразований кишечника

42. 3 варианта теста Колонофлор

• Колонофлор-биоценоз (23 показателей) – внимание на облигатно и
условно-патогенную микробиоту
• Колонофлор-метаболизм (18 показателей) – внимание на
нормобиоту метаболизма
• Колонофлор комплекс (33 показателя) – полная оценка всех
параметров
42

43. Пример результата теста Колонофлор комплекс

43

44. Клинически значимые изменения, определяемые Колонофлором

• Снижение содержания облигатных представителей
микробиоценоза (бифидобактерий и/или
лактобацилл)
• без увеличения количества сапрофитной или
условно-патогенной микрофлоры;
• сочетающееся с выраженными изменениями в
аэробной микрофлоре – редукцией лактобацилл,
появлением измененных форм кишечной палочки,
обнаружение одного или нескольких
представителей патогенных микроорганизмов в
высоких титрах;

45. Клинически значимые изменения, определяемые Колонофлором

• Обнаружение в фекальных образцах в диагностически значимых
количествах (более 104) грибов рода Candida и условно-патогенных
бактерий (Klebsiella spp, Staphylococcus aureus, Clostridium difficile,
Clostridium perfringens);
• Значительное снижение числа Fаecalibacterium prauznitzii и
соответственно изменение количественного соотношения Bacteroides
fragilis/ Fecalibacterium prauznitzii;
• Изменение соотношения субпопуляций анаэробных бактерий,
осуществляющих различные виды брожения (например, продуцентов
бутирата и продуцентов пропионата).

46. Энтерофлор® Дети ДНК-Технология, Россия

Полное наименование набора реагентов: Набор
реагентов для исследования состава микробиоты
толстого кишечника в образцах кала детей методом
ПЦР в режиме реального времени (Энтерофлор®
Дети).
Назначение: Набор реагентов предназначен для
определения качественного состава и
количественной оценки микробиоты толстого
кишечника у детей от 0 до 14 лет
Преимущества: 43 показателя, 99% микробиоты
кишечника
46

47. Правила подготовки к сдаче биоматериала

• Специальная подготовка к исследованию
не требуется.
• Через 2 дня после окончания приёма
энтеросорбентов, пробиотиков.
• Кал или меконий собрать в контейнер в
количестве одной мерной ложки
• Хранение: при комнатной температуре
(от 18 °С до 25 °С) не более 6 часов
• При температуре от 2 °С до 8 °С не более
3 суток
Собрать материал просто!
47

48. Нормобиота в тесте Энтерофлор®Дети

Филум Bacillota
Clostridium leptum gr Lachnospiraceae
Lactobacillaceae
Faecalibacterium
Streptococcus spp.
prausnitzii
Dialister+Allisonella+Meg Lactococcus lactis
asphaera+Veillonella
Филум Actinomycetota:
Bifidobacterium spp
Метаболически активные «детские» виды
Метаболически активные «взрослые» виды
Coriobacteriia
Филум Bacteroidota
Alistipes spp.
Bacteroides spp.
Butyricimonas spp.
Parabacteroides spp.
Prevotella spp.
Другие виды
•Akkermansia muciniphila
•Desulfovibrio spp.
•Methanobrevibacter spp
48

49. Условно-патогенная микробиота (патобионты) и маркеры патогенности

• Clostridium difficile gr
• Clostridium perfringens gr
• Enterobacterales
• E.coli
• Enterococcus spp
• Erysipelotrichaceae
• Fusobacteriaceae
• Peptoniphilaceae
• Pseudomonas spp
• Staphylococcus spp.
• Clostridioides difficile
• cdtA cdtB
• Staphylococcus aureus
• mecA
• Streptococcus agalactiae
• Srr2
• Дрожжевые грибы
• Candida spp
• C.albicans
49

50. Интерпретация результата, структура заключения

• Оцениваются и выводятся в заключение значения основных
показателей:
-
Доля нормобиоты;
Количество бифидобактерий;
Разнообразие нормобиоты;
Количество Lactobacillaceae;
• Дополнительная информация (также выводится в текст
заключения):
- Спектр бифидобактерий (метаболически активные, «взрослые»,
«детские»);
- Наличие бактероидов;
- Количество Candida spp.;
- Наличие патобионтов
- Выявленные маркеры патогенности и резистентности.
50

51. Мальчик 7 лет. НОРМА

51

52. Возможные отклонения в составе кишечной микробиоты, выявляемые тестом Энтерофлор®Дети

• Снижение количества и/или доли бифидобактерий
• Снижение количества и/или доли лактобацилл
• Снижение разнообразия нормобиоты
• Отсутствие некоторых представителей нормобиоты
• Снижение доли нормобиоты / повышение доли условнопатогенной микробиоты
• Выявление патобионтов
• бактерий и генов их токсигенности или инвазивности
• выявление генов устойчивости к антибиотикам
• повышение содержания грибов Candida spp.
• обнаружение Candida albicans
Возможно выявление сразу нескольких отклонений!
52

53. Способы элиминации патогенов

• Прямое уничтожение
• Антимикробные препараты
• Бактериофаги
• Вытеснение
• Назначение пробиотических
препаратов, содержащих
антагонистические штаммы
53

54. Давать бактерии или кормить бактерии?

54

55. Пребиотики

• Невсасывающиеся вещества, которые оказывают положительный
физиологический эффект на хозяина, селективно стимулируя
необходимый рост или активность кишечной микробиоты.
• Не расщепляются пищеварительными ферментами в верхних
отделах кишечника.
• Являются необходимым субстратом для бактерий толстого
кишечника
• Сложные углеводы, пищевые волокна.

56. Бифидобактерии - ключевая группа микробиоты кишечника младенцев

• Преобладают у детей на грудном вскармливании – составляют до
90% микробиоты кишечника.
Специфические «детские» виды бифидобактерий:
B. breve, B. longum subsp. infantis, B. longum subsp. longum, B.
bifidum
• Доля бифидобактерий физиологически снижается с введением
прикорма и переходом на взрослый тип питания, в пожилом
возрасте – доля в составе микробиоты не более 2-15%.
«Взрослые» виды бифидобактерий:
B. adolescentis, B. catenulatum, B. pseudocatenulatum, B.
longum subsp. longum
56

57. Сниженное содержание бифидобактерий в микробиоте кишечника

• Дисбиоз кишечника
• Нарушение углеводного
обмена
• Снижение синтеза витаминов
и гиповитаминоз
• Ухудшение всасывания
жирорастворимых витаминов
(витамина Д)
• Негативное влияние на
местный иммунитет
• Повышенный индекс массы
тела и ожирением
• Диабет 2 типа
• Атопия и аллергические
заболеваниями
• Инфекции желудочнокишечного тракта
• Нарушения
нейропсихического развития,
заболевания аутистического
спектра
57

58. Мальчик 1 год снижена доля метаболически активных «детских» бифидобактерий

Жалобы: жидкий стул 3-5 раз в сутки вздутие постоянной
голод;
Анамнез: В 1 мес лечение антибиотиками по поводу
пневмонии.
Диагноз: K30,Функциональная диспепсия. Умеренная
гепатомегалия.
58

59. Мальчик 10 лет Снижена доля метаболически активных «взрослых» бифидобактерий.

Анамнез: срочные естественные роды, грудное
вскармливание, прикорм с 6 месяцев
Диагноз: атопический дерматит
Пролечена глистная инвазия в течение
предыдущего года
59

60. Род Lactobacillus и его роль в составе микробиоты кишечника у новорожденных

Род Lactobacillus и его роль в составе
микробиоты кишечника у новорожденных
• В меконии обнаруживаются различные виды Lactobacillus:
• L. reuteri , L. plantarum , L sadei , L. brevis и L casei
• Источником лактобацилл для новорожденного является также
грудное молоко
• L. plantarum и L. pentosus
• Ключевая функция лактобацилл в кишечнике новорожденного –
переваривание олигосахаридов грудного молока (ОГМ)
• Основной метаболит – молочная кислота
• Синтезируют ГАМК – внимание, эмоциональный контроль
• Модулируют местный иммунитет
https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.708472
60

61. Девочка 3 года

• Снижено количество и доля бифидобактерий
• отсутствуют лактобациллы
• снижено содержание бактероидов
Анамнез: кесарево сечение 38 недель, вскармливание
смешанное, прикорм с 5 месяцев
Жалобы: боли, спазмы, метеоризм, запор, дефицит В12
Диагноз: дискинезия желч.путей, СРК,СИБР
Перенесенные заболевания: ОКИ, кандидоз кишечника в
течение предшествующего полугода
61

62. Филум Bacteroidota

• Bacteroides появляются через 10 дней после рождения.
• Занимают значимое место в микробиоте кишечника после
отлучения от груди.
• B. thetaiotaomicron расщепляют сложные сахара, обеспечивая
энергией не только себя, но и организм хозяина и другие
бактерии.
• Модулируют иммунную систему хозяина
• Предотвращают колонизацию патогенными батериями
• Преобладание Bacteroides в кишечной микробиоте
ассоциировано с нормальным весом
Wexler HM. Bacteroides: the good, the bad, and the nitty-gritty. Clin Microbiol Rev. 2007 Oct;20(4):593-621.
62
doi: 10.1128/CMR.00008-07. PMID: 17934076; PMCID: PMC2176045.

63.

Allistipes spp.
Butyricimonas spp.
• Продуценты ацетата и пропионата
• Связывают с эффективной потерей веса
На фоне приема метформина и статинов
увеличивается содержание Butyricimonas
• Снижение:
• негативный прогноз при
гепатоцеллюлярной карциноме,
некоторых сердечно-сосудистых
заболеваний.
• Избыток:
• ассоциирован с провоспалительным
окружением в кишечнике,
• маркер потенциально
развивающегося колита
• ассоциирован с депрессивными
расстройствами
Назначение Butyricimonas virosa увеличивало
толерантность к глюкозе, нормализовало
уровень инсулина у мышей, получавшихся
диету с высоким содержанием жиров
https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.00906
Описан случай перитонита, вызванный
Butyricimonas virosa у 65-летнего пациента
doi: 10.3389/fmicb.2019.01947,
doi.org/10.3389/fmicb.2022.858192
doi: 10.1080/19490976.2017.1405209
doi.org/10.1159/000525177
63

64. Девочка 8 лет

57% нормобиоты представлено Alistipes spp.
Снижено содержание и доля бифидобактерий
лактобациллы отсутствуют
разнообразие нормобиоты на нижней границе
норматива
Анамнез: срочные роды, кесарево сечение, грудное
вскармливание до 6 месцев.
Жалобы: сниженный аппетит, нарушения стула (частые
запоры или жидкий стул), частые ОРЗ (раз в месяц
фарингиты, тонзиллиты, ларингиты с высокой
температурой).
Снижена масса тела
64

65. Девочка 11 лет

снижена доля взрослых бифидобактерий
отсутствуют лактобациллы
снижено содержание бактероидов
отсутствует Alistipes spp.
снижено разнообразие нормобиоты
Анамнез: естественные роды, грудное
вскармливание
Жалобы: на периодические (1 раз в месяц)
эпизоды диареи
Избыточный вес
65

66. Faecalibacterium prausnitzii – «бактерия радости»

• Основной продуцент короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК)
• Обладает противовоспалительным потенциалом
Снижение количества:
• Угнетение иммунного ответа
• Нарушение барьерной функции эпителия кишечника
• Играет роль в развитии воспалительных заболеваний кишечника - ВЗК (НЯК, болезнь
Крона)
• Риск депрессивных состояний

67. Akkermansia muciniphila - представитель филума Verrucomicrobiota

• Расщепляет муцин слизистой оболочки и стимулирует его выработку.
• Продукты расщепления муцина - пропионовая и уксусная кислоты становятся субстратом для F. prausnitzii
• Снижает уровень провоспалительных цитокинов, которые связаны с
психическими расстройствами, в том числе депрессией
• Снижает когнитивные нарушения, такие как проблемы с памятью и
вниманием.
• Низкий уровень
• Ожирении,
• метаболическом синдроме.
• Повышенное содержание
• У пациентов с аутоиммунной патологией

68. Desulfovibrio spp. - cульфатредуцирующие бактерии (СРБ)

• Колонизация кишечника СРБ возможна благодаря наличию сульфата,
полученного в результате деградации сульфомуцина, содержащегося в
эпителиальных клетках кишечника.
• Избыток СРБ ассоциирован с
• Хроническими воспалительными заболеваниями ЖКТ (язвенный колит, болезнь Крона,
синдром раздраженного кишечника),
• различными психическими и когнитивными расстройствами (болезнь Паркинсона,
расстройство аутистического спектра (РАС),
• синдром дефицита внимания / гиперактивность (СДВГ),
• биполярное расстройство, шизофрения и большое депрессивное расстройство
DOI: 10.1128/AEM.02851-10
68

69. Methanobrevibacter smithii

• Основной представитель метанобразующих архей кишечника;
• Утилизирует водород и углекислый газ с образованием метана,
что стимулирует процесс ферментации пищи сахаролитическими
бактериями.
• Повышенное содержание:
• ассоциировано с ожирением;
• инсулинорезистентностью;
• сахарным диабетом 2 типа.
• Сниженное содержание:
• приводит к активации процессов брожения и гниения в кишечнике;
• характерно для ВЗК;
• обсуждается роль в патогенезе ожирения и колоректального рака.

70. Мальчик 9 месяцев Отсутствуют Bacteroidetes, A.muciniphila, Desulfovibrio spp., Metanobrevibacter spp.

Анамнез: срочные роды, грудное
вскармливание без прикорма
Жалобы: беспокойное поведение, плохой
сон
70

71. Мальчик 1 год

• Отсутствуют Bacteroidetes, A.muciniphila, Desulfovibrio
spp., Metanobrevibacter spp. Faecalibacterium prausnitzii
• Повышено количество Staphylococcus aureus
Анамнез: срочные роды, грудное вскармливание до 5 месяцев. НСГ ишемия легкой степени тяжести.
Жалобы: Не любит жевать, предпочитает есть протертую пищу.
Трудности засыпания. Дробный сон. Периодически берет в рот
несъедобные предметы.
Диагноз: G96.8,Темповая задержка речевого развития. Начальные
проявления нарушения пищевого поведения. Функциональные
парасомнии. Протестное поведение;
K59.8 Другие уточненные функциональные кишечные нарушения
L23.9 Аллергический контактный дерматит
71

72. Мальчик 2 года

• снижено количество доля бифидобактерий,
присутствуют потенциально патогенные
энтеробактерии:
Enterobacterales 7,4 lg против E.coli 5,9 lg
Жалобы: неустойчивый стул – разжиженный,
запах ацетона после употребления выпечки и
сладостей;
Анамнез заболевания: отдыхали в Египте 2
месяца назад, перенес ОКИ.
Копрограмма - йодофильная флора в умеренном
кол-ве, клетчатка неперевар в большом кол-во.
Лечение нифурател, пробиотики
72

73. Мальчик 3 года 9 месяцев

разнообразие нормобиоты – 2
бифидобактерии и лактобациллы отсутствуют
Faecalibacterium prausnitzii отсутствуют
преобладает 1 род – Streptococcus spp.
повышено количество Candida spp.
Анамнез: лечение противотуберкулезными
препаратами более полугода.
Жалобы: диарея
73

74. Девочка, 5 лет выявлены С.difficile с генами токсигенности S.aureus с геном mecA повышено содержание Candida spp. снижено

количество бактероидов
Жалобы: после лечения отита антибиотиками
жидкий стул (3-4 раза в день) с примесью крови
Кальпротектин 281 мкг/г (норма до 75)
Токсины C. difficile не обнаружены
Копрограмма - без воспалительных изменений
74

75. Мальчик 2 месяца

• снижена доля нормобиоты
• снижено количество и доля бифидобактерий
• Повышено содержание Enterobacterales (7,5 lg,
47% всей микробиоты )
• выявлен S.aureus с геном mecA
• повышено Candida spp.
Анамнез: срочные роды, кесарево сечение,
смешанное вскармливание
Жалобы: высыпания на сгибах коленных, локтевых
суставов, зуд
Диагноз: дерматит?
75

76. Мальчик 2 месяца

76

77. Энтерофлор®Дети – путь к персонализированной терапии

Пути коррекции нарушений микробиоты кишечника
Антимикробные
препараты
Бактериофаги
Пробиотики и
пребиотики
Коррекция
диеты и
образа жизни
77

78. Спасибо за внимание!