Расчет свободной энергии с помощью молекулярной динамики
Свободная энергия?
Свободная энергия Гиббса
Свободная энергия Гиббса
Предсказательная сила
Вероятность найти систему в состоянии i
Как посчитать?
Растворение
Метод Видома
Растворение большой молекулы
Перекрывание фазовых пространств
Перекрывание фазовых пространств
Перекрывание фазовых пространств
Растворение большой молекулы
Растворение большой молекулы
Алхимические превращения
Мягкое ядро (soft core)
На практике
ΔG для разных λ
Суммарная ΔG
Перекрывание распределений
Или суммировать с весами?
Свободная энергия растворения C8E6
Растворение нескольких молекул
Термодинамический цикл
Свободная энергия гидрофобного взаимодействия
Umbrella sampling
Потенциал средней силы
PMF
Нифедипин
Сходимость PMF
Литература
Литература
Thank you!
Диффузия и проницаемость
Диффузия и проницаемость
PMF для разных молекул
Проницаемость: корреляция теории и эксперимента
Проницаемость: предсказание
5.20M
Category: physicsphysics

Расчет свободной энергии с помощью молекулярной динамики

1. Расчет свободной энергии с помощью молекулярной динамики

Ким Александра Валерьевна,
Институт химической кинетики и горения СО РАН,
Новосибирск

2. Свободная энергия?

2

3. Свободная энергия Гиббса

English     Русский Rules