Problem-solving. Test: real-time polymerase chain reaction

1.

Problem-solving Test: Real-time Polymerase Chain
Reaction

2.

3.

Цель опыта - сравнить количество гена HER2 в
двух образцах ткани.
Реакционные смеси содержали:
ДНК-матрицу
Праймеры
Зонд TaqMan
Полимераза Taq
Дексорибонуклеозидтрифосфат

4.

5.

6.

Образует фосфодиэфирные связи.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

7.

Образует фосфодиэфирные связи.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

8.

Cleaves (разрезание)
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

9.

Cleaves (разрезание)
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

10.

Разрывает водородные связи.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

11.

Разрывает водородные связи.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

12.

Зависит от праймера.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

13.

Зависит от праймера.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

14.

Разлагает праймеры на мононуклеотиды.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

15.

Разлагает праймеры на мононуклеотиды.
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

16.

Разлагает зонд TaqMan на мононуклеатиды
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

17.

Разлагает зонд TaqMan на мононуклеатиды
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

18.

Функция коррекции
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

19.

Функция коррекции
A. 5’→3’ элонгационная активность Taq полимеразы
B. 5’→3’ экзонуклеазная активность Taq полимеразы
C. Обе
D. Ни одна из них

20.

По мере протекания реакций ПЦР в какой-то
момент флуоресценция усиливается в обеих
смесях. Какой процесс может это объяснить?
А. Молекулы зонда TaqMan разлагаются на нуклеотиды.
Б. Молекулы зонда TaqMan расщепляются на более
мелкие олигонуклеотиды
C. Молекулы зонда TaqMan высвобождаются из
матрицы в виде интактных олигонуклеотидов.
D. Молекулы зондов TaqMan служат праймерами для
полимеразы Taq
E. Молекулы зонда TaqMan встраиваются во вновь
синтезированные цепи ДНК.

21.

По мере протекания реакций ПЦР в какой-то
момент флуоресценция усиливается в обеих
смесях. Какой процесс может это объяснить?
А. Молекулы зонда TaqMan разлагаются на нуклеотиды.
Б. Молекулы зонда TaqMan расщепляются на более
мелкие олигонуклеотиды
C. Молекулы зонда TaqMan высвобождаются из
матрицы в виде интактных олигонуклеотидов.
D. Молекулы зондов TaqMan служат праймерами для
полимеразы Taq
E. Молекулы зонда TaqMan встраиваются во вновь
синтезированные цепи ДНК.

22.

Почему после нескольких первых циклов ПЦР в
образцах не наблюдается флуоресценции?
• A. Потому что полимераза Taq разрушает молекулы
зонда TaqMan.
• Б. Поскольку полимераза Taq разрушает праймеры.
• C. Потому что нет синтеза ДНК.
• D. Потому что гасители блокируют флуоресценцию
всех молекул репортерного красителя.
• E. Потому что детектор флуоресценции недостаточно
чувствителен.

23.

Почему после нескольких первых циклов ПЦР в
образцах не наблюдается флуоресценции?
• A. Потому что полимераза Taq разрушает молекулы
зонда TaqMan.
• Б. Поскольку полимераза Taq разрушает праймеры.
• C. Потому что нет синтеза ДНК.
• D. Потому что гасители блокируют флуоресценцию
всех молекул репортерного красителя.
• E. Потому что детектор флуоресценции недостаточно
чувствителен.

24.

Почему флуоресценция не увеличивается после
30 цикла ни в одном из образцов?
• A. Поскольку были использованы все молекулы
праймеров
• Б. Потому что были использованы все молекулы
зондов TaqMan.
• C. Потому что были использованы все молекулышаблоны.
• D. A и B.
• E. A, B и C. 1

25.

Почему флуоресценция не увеличивается после
30 цикла ни в одном из образцов?
• A. Поскольку были использованы все молекулы
праймеров
• Б. Потому что были использованы все молекулы
зондов TaqMan.
• C. Потому что были использованы все молекулышаблоны.
• D. A и B.
• E. A, B и C. 1

26.

Что случилось с геном HER2 в клетках опухоли
груди?
• A. Его количество копий увеличилось примерно в 30
раз.
• Б. Количество его копий увеличилось примерно в 5
раз,
• C. Количество копий уменьшилось примерно в 30 раз,
• D. Количество копий уменьшилось примерно в 5 раз,
• E. Его экспрессия снизилась примерно в 5 раз.

27.

Что случилось с геном HER2 в клетках опухоли
груди?
• A. Его количество копий увеличилось примерно в 30
раз.
• Б. Количество его копий увеличилось примерно в 5
раз,
• C. Количество копий уменьшилось примерно в 30 раз,
• D. Количество копий уменьшилось примерно в 5 раз,
• E. Его экспрессия снизилась примерно в 5 раз.

28.

(В этом типе вопросов парные утверждения
описывают две сущности, которые необходимо
сравнить в количественном смысле. Выберите A.,
если A больше B. B., если B больше A. C., если
эти два равны или почти равны.)
• A. Количество свободных молекул праймера в
образце A после цикла 4.
• Б. Количество свободных молекул праймера в
образце А после 10 цикла.

29.

(В этом типе вопросов парные утверждения
описывают две сущности, которые необходимо
сравнить в количественном смысле. Выберите A.,
если A больше B. B., если B больше A. C., если
эти два равны или почти равны.)
• A. Количество свободных молекул праймера в
образце A после цикла 4.
• Б. Количество свободных молекул праймера в
образце А после 10 цикла.

30.

• A. Количество свободных молекул праймера в
образце A после цикла 10.
• B. Количество свободных молекул праймера в
образце B после 10 цикла.

31.

• A. Количество свободных молекул праймера в
образце A после цикла 10.
• B. Количество свободных молекул праймера в
образце B после 10 цикла.

32.

• A. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце A после цикла 10.
• B. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце B после цикла 10.

33.

• A. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце A после цикла 10.
• B. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце B после цикла 10.

34.

• A. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце A после цикла 18.
• B. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце B после цикла 18.

35.

• A. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце A после цикла 18.
• B. Количество свободных молекул зонда TaqMan в
образце B после цикла 18.

36.

• A. Количество репортерных комплексов краситель /
мононуклеотид в образце A после 18 цикла.
• B. Количество репортерных комплексов краситель /
мононуклеотид в образце B после цикла 18.

37.

• A. Количество репортерных комплексов краситель /
мононуклеотид в образце A после 18 цикла.
• B. Количество репортерных комплексов краситель /
мононуклеотид в образце B после цикла 18.

38.

• A. Количество амплифицированных фрагментов HER2
в образце A после цикла 20.
• B. Количество амплифицированных фрагментов
HER2 в образце B после цикла 20.

39.

• A. Количество амплифицированных фрагментов HER2
в образце A после цикла 20.
• B. Количество амплифицированных фрагментов
HER2 в образце B после цикла 20.

40.

• A. Количество амплифицированных фрагментов HER2
в образце A после цикла 30.
• B. Количество амплифицированных фрагментов HER2
в образце B после цикла 30.

41.

• A. Количество амплифицированных фрагментов HER2
в образце A после цикла 30.
• B. Количество амплифицированных фрагментов HER2
в образце B после цикла 30.

42.

Спасибо за внимание