Методы изучения хроматина
План
1. Структура хроматина
Нуклеосомный уровень «бусины на нити»
Страшные картинки
Активность хроматина
Хромосомные территории
Хромосомные территории в ядрах FISH
FISH
Хромосомные территории в ядрах FISH
Мечение новой нити ДНК
Репликативные паттерны
ТАДы и Hi-C
ТАДы и Hi-C
Регуляция транскрипции генов
Регуляция транскрипции генов
Укладка хроматина в ТАДы
2. Что изучает наша лаборатория
Направления
Функции когезинового комплекса
Поведение сестринских хроматид после репликации
Мечение сестринских хроматид
Меченные dCas9‑mEGFP локусы
Меченные dCas9‑mEGFP локусы, электронная микроскопия
Причем тут когезин?..
3. Научная журналистика
Как сделать научную новость
Наш редактор Елена Клещенко
10.43M
Category: biologybiology

Методы изучения хроматина

1. Методы изучения хроматина

Харыбина Екатерина
- Кафедра клеточной биологии и гистологии биофака МГУ
- Отдел электронной микроскопии НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского
- Портал PCR.news

2. План

1. Хроматин и методы его изучения
2. Что изучает наша лаборатория
3. Научная журналистика

3. 1. Структура хроматина

Ou et al., 2017 с изменениями

4. Нуклеосомный уровень «бусины на нити»

нуклеосома
ДНК
гистоны
Строение нуклеосомы

5. Страшные картинки

Изоформы и посттрансляционные модификации гистонов
Zhao et al., 2013

6. Активность хроматина

Эухроматин
- активный
- рыхлый
- рано реплицируется
Гетерохроматин
- неактивный
- компактный
- поздно реплицируется

7. Хромосомные территории

Хромосомы
расположены
хаотично
У каждой
хромосомы своя
территория
T. Cremer, M. Cremer, 2010

8.

Хромосомные территории
UV Облучение и меченые нуклеотиды
T. Cremer, M. Cremer, 2010

9. Хромосомные территории в ядрах FISH

FISH – флуоресцентная гибридизация in situ

10. FISH

денатурация
гибридизация
меченый
олигонуклеотид

11. Хромосомные территории в ядрах FISH

FISH – флуоресцентная гибридизация in situ
T. Cremer, C. Cremer, 2001, адаптация

12. Мечение новой нити ДНК

EdU – аналог тимидина
Включение в
новую цепь ДНК
Проявление
Азид с флуорофором

13. Репликативные паттерны

первый
второй
Эухроматин
Гетерохроматин
5 мкм
третий
четвертый

14. ТАДы и Hi-C

определение конформации хромосом
ТАДы – топологически ассоциированные домены

15. ТАДы и Hi-C

16. Регуляция транскрипции генов

транскрипция?
энхансер
промотор

17. Регуляция транскрипции генов

транскрипция?
энхансер
промотор
образование петли
энхансер
промотор
транскрипция!

18. Укладка хроматина в ТАДы

Song, Kim, 2017, с изменениями

19.

@sketchingscience

20. 2. Что изучает наша лаборатория

21. Направления

Ядерная ламина
Когезины и репликация

22. Функции когезинового комплекса

• контроль когезии сестринских хроматид
• участие в репликации и репарации ДНК
• регуляция экспрессии генов
• организация хроматина в интерфазе

23.

24. Поведение сестринских хроматид после репликации

Распределение репликативной
метки EdU в хроматиновых
фибриллах, электронная
микроскопия
Deng et al., 2016
Расхождение меченого FISH
локуса в клетках
Schmitz et al., 2007

25. Мечение сестринских хроматид

EGFP
Мечение сестринских
хроматид
dCas9

26. Меченные dCas9‑mEGFP локусы

Меченные dCas9-mEGFP локусы
интерфаза
митоз

27. Меченные dCas9‑mEGFP локусы, электронная микроскопия

Меченные dCas9-mEGFP локусы,
электронная микроскопия

28.

Меченные dCas9-mEGFP локусы в профазе,
электронная микроскопия

29. Причем тут когезин?..

Зачем это вообще нужно?..
• Фундаментальная наука
• Мутации в белках когезинового комплекса и его регуляторах:
– Опухолевая трансформация клеток
– Бесплодие и пороки развития
– Когезинопатии

30. 3. Научная журналистика

31.

32. Как сделать научную новость

33. Наш редактор Елена Клещенко

34.

Сайт PCR.news и
паблики в ВК и ФБ
Статьи на Биомолекуле
про хроматин

35.

Чувак, митоз начинается через 5 минут...
А ты до сих пор не сконденсировался!
English     Русский Rules