«большие данные» о биоразнообразии (лекция 4)

1.

Полевая биология для небиолога: среда iNaturalist для документации
биоразнообразия
Field biology for a non-biologist: iNaturalist environment for biodiversity
documentation
Осенний семестр 2023/2024 гг.
Серегин Алексей Петрович, доктор биологических наук,
кафедра экологии и географии растений биологического факультета МГУ, [email protected]
Дудова Ксения Вячеславовна, кандидат биологических наук,
кафедра экологии и географии растений биологического факультета МГУ, [email protected]

2.

Полевая биология для небиолога: среда iNaturalist для документации
биоразнообразия
Field biology for a non-biologist: iNaturalist environment for biodiversity
documentation
Лекция 4. «Большие данные» о биоразнообразии.
Серегин Алексей Петрович, доктор биологических наук,
кафедра экологии и географии растений биологического факультета МГУ, [email protected]

3.

Большие данные
в открытом доступе

4.

5.

6.

7.

8.

19.09.2023

9.

10.

Большие данные
о биоразнообразии

11.

Журнал «Science» (2000)
11

12.

8.02.2022
29.08.2019
19.09.2023

13.

2.10.2022

14.

19.09.2023

15.

2.10.2022

16.

2.10.2022

17.

Структура данных
Что внутри GBIF?

18.

Все группы
19.09.2023

19.

Все группы
19.09.2023

20.

Все группы: 25-е место
19.09.2023

21.

Сосудистые растения
19.09.2023

22.

Сосудистые растения: 15-е место
19.09.2023

23.

2.10.2022

24.

2.10.2022

25.

Может, дело в новых технологиях?

26.

Может, дело в новых технологиях?
GPS-трекеры на крупных
перелетных птицах и
откармливающихся по
полгода пингвинах

27.

Нет, дело в людях!
И эволюции смартфонов
2008
Камера
2МП
ОЗУ
128 МБ
Память
16 ГБ
Аккумулятор 1150 мА*ч
2023
Камера
48МП
ОЗУ
8 ГБ
Память
1024 ГБ
Аккумулятор 4422 мА*ч

28.

«Наблюдение» как основа
современных данных
о биоразнообразии

29.

2.10.2022

30.

Все группы
19.09.2023

31.

1.10.2023

32.

33.

1.10.2023

34.

1.10.2023

35.

16.09.2021

36.

2.10.2022

37.

2.10.2022

38.

1.10.2023

39.

2.10.2022

40.

GBIF и iNaturalist
Стратегическое партнёрство

41.

1.10.2023

42.

В GBIF из iNaturalist идет только
45% данных (72 млн из 160 млн).
Требуются открытые лицензии и
исследовательский уровень.
1.10.2023

43.

44.

Скорость отправки данных
1.10.2023

45.

18.03.2023

46.

18.03.2023

47.

18.03.2023

48.

Цитируемость
1.10.2023

49.

Использование
1.10.2023

50.

Точки находок копытня (Asarum europaeum)
в Европе как они отображаются на iNaturalist
(вверху слева) и на iNaturalist со слоем GBIF-точек
(внизу справа)

51.

Три пути попадания новых данных в GBIF
из iNaturalist
• Загрузка новых наблюдений
• Определение наблюдений, получение «Исследовательского
уровня»
• Выставление лицензий CC0, CC-BY, CC-BY-NC для наблюдений с
пометкой «Все права защищены»

52.

Ключевые особенности России на iNaturalist
• Преобладают наблюдения сосудистых растений
Россия: 55,4%
Мир: 39,3%
• Преобладают наблюдения со свободными лицензиями (CC0, CC-BY, CC-BY-NC)
Россия: 90,3%
Мир: 71,3%
• Преобладают верифицированные наблюдения
Россия: 80,9%
Мир: 62,1%
• Очень высокий показатель «наблюдений на человека»
Россия: 172,5 шт.
Мир: 56,3 шт.
• Доля данных в GBIF
Россия: 73,0%
Мир: 45,2%
9.10.2023

53.

Оцифровка коллекций
Музейные и гербарные образцы в цифре

54.

2.10.2022

55.

16.09.2021

56.

8.02.2022

57.

58.

59.

8.02.2022

60.

61.

62.

63.

64.

Сосудистые растения
1.10.2023

65.

Париж
Нью-Йорк
Кью
Москва

66.

P00747877
K000464620
NY00247926
MW0734831

67.

Сосудистые растения: коллекции
1.10.2023

68.

Сосудистые растения: коллекции
Гербарий МГУ на 15-м месте
2.10.2023

69.

1.10.2023

70.

71.

2.10.2022
9.10.2023

72.

16.09.2021
2.10.2022

73.

2.10.2022

74.

2.10.2022

75.

76.

1.10.2023

77.

2.10.2022

78.

Россия в GBIF
Данные о флоре и фауне страны в GBIF

79.

16.09.2021
2.10.2022

80.

19.09.2023

81.

1.10.2023

82.

Все группы: Россия
19.09.2023

83.

Сосудистые растения: Россия
19.09.2023

84.

Помогатор: домашнее задание
Знакомимся с Цифровым гербарием МГУ

85.

86.

87.

88.

89.

90.

Критерий оценивания
• Необходимо в счётчике «правильных ответов» набрать в сумме
как минимум 100 баллов (задания должны быть при этом из трёх
разных миссий) и при этом не более 10 баллов в категории
«неправильные ответы».
• «Не уверен – пропускай».
• Принцип: двойной «слепой» ввод.

91.

Полевая биология для небиолога: среда iNaturalist для документации
биоразнообразия
Field biology for a non-biologist: iNaturalist environment for biodiversity
documentation
Осенний семестр 2023/2024 гг.
Серегин Алексей Петрович, доктор биологических наук,
кафедра экологии и географии растений биологического факультета МГУ, [email protected]
Дудова Ксения Вячеславовна, кандидат биологических наук,
кафедра экологии и географии растений биологического факультета МГУ, [email protected]