Similar presentations:
Большие данные о разнообразии растений России в открытом доступе
1.
Большие данные оразнообразии растений России
в открытом доступе
Уфа, 21.09.2023
2.
Большие данныев современной науке
3.
4.
5.
6.
7.
19.09.20238.
9.
Большие данныео биоразнообразии
10.
Журнал «Science» (2000)10
11.
8.02.202229.08.2019
19.09.2023
12.
2.10.202213.
19.09.202314.
19.09.202315.
19.09.202316.
Все группы19.09.2023
17.
Все группы19.09.2023
18.
Все группы: 25-е место19.09.2023
19.
Сосудистые растения19.09.2023
20.
Сосудистые растения: 15-е место19.09.2023
21.
2.10.202222.
Может, дело в новых технологиях?23.
Может, дело в новых технологиях?GPS-трекеры на крупных
перелетных птицах
24.
Может, дело в новых технологиях?GPS-трекеры на откармливающихся
по полгода пингвинах
24
25.
Нет, дело в людях!И эволюции смартфонов
2008
Камера
2МП
ОЗУ
128 МБ
Память
16 ГБ
Аккумулятор 1150 мА*ч
2023
Камера
48МП
ОЗУ
8 ГБ
Память
1024 ГБ
Аккумулятор 4422 мА*ч
26.
«Наблюдение» как основасовременных данных
о биоразнообразии
27.
2.10.202228.
Все группы19.09.2023
29.
2.10.202230.
31.
2.10.202232.
2.10.202233.
16.09.202134.
2.10.202235.
2.10.202236.
2.10.202237.
2.10.202238.
Сосудистые растения19.09.2023
39.
21.02.202340.
21.02.202341.
2.10.202242.
43.
2.10.202244.
2.10.202245.
2.10.202246.
2.10.202247.
2.10.202248.
2.10.202249.
2.10.202250.
Россия в GBIFДанные о флоре и фауне страны в GBIF
51.
16.09.202119.09.2023
52.
Все группы: Россия19.09.2023
53.
Источники (электронных) данных• Гербарные коллекции
• Литература
• Наблюдения
54.
Сосудистые растения: Россия19.09.2023
55.
19.09.202356.
19.09.202357.
19.09.202358.
59.
19.09.202360.
19.09.202361.
Ключевые особенности России на iNaturalist• Преобладают наблюдения сосудистых растений
Россия: 57,4%
Мир: 39,4%
• Преобладают наблюдения со свободными лицензиями (CC0, CC-BY, CC-BY-NC)
Россия: 88,3%
Мир: 66,5%
• Преобладают верифицированные наблюдения
Россия: 80,0%
Мир: 61,7%
• Очень высокий показатель «наблюдений на человека»
Россия: 144,8 шт.
Мир: 49,3 шт.
• Доля данных в GBIF
Россия: 71,1%
Мир: 44,0%
6.12.2022
62.
14.07.202363.
Первые 1500 наблюдений каждого летапо флоре России
21.05.2023
64.
Компьютерное зрение iNaturalist: виды21.05.2023
65.
Компьютерное зрение iNaturalist:наблюдения
21.05.2023
66.
2.10.202267.
2015В Гербарии МГУ мы начали полное сканирование
коллекции по проекту «Ноев ковчег» (грант РНФ)
68.
MWMW
69.
70.
71.
Самые большие гербарии России1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
Организация
Санкт-Петербург, БИН РАН
Москва, МГУ
Санкт-Петербург, СПбГУ
Новосибирск, ЦСБС РАН
Москва, ГБС РАН
Владивосток, ФИЦБ РАН
Томск, ТГУ
Сыктывкар, ИБ КНЦ РАН
Санкт-Петербург, ВИР
Ростов-на-Дону, ЮФУ
Thiers (2022) The World’s Herbaria 2021
Акроним
LE
MW
LECB
NS + NSK
MHA
VLA
TK
SYKO
WIR
RV
Фонды
6 000 000
1 085 561
800 000
740 000
610 000
500 000
500 000
407 000
376 825
350 000
72.
MWСколько образцов оцифровано?
Россия:
• 16,4 млн образцов
• 1,6 млн оцифровано (отсканировано)
• 9,5% доля оцифрованных коллекций
MW
Мир:
• 397,6 млн образцов
• около 86,8 млн оцифровано и доступно в GBIF
• 21,8% оцифрованных коллекций
Источники: Thiers (2021), Index Herbariorum и др.
Original counts and estimates
73.
Ведущие цифровые гербарии РоссииОрганизация
Код
Сканов
Доля
Сайт
1
Москва, МГУ
MW
1 015 242
94%
https://plant.depo.msu.ru/
https://www.gbif.org/
2
3
Санкт-Петербург, БИН РАН
Москва, ГБС РАН
LE
MHA
141 253
106 627
2%
17%
http://herbariumle.ru/
https://plant.depo.msu.ru/
https://www.gbif.org/
4
Новосибирск, ЦСБС СО РАН
NS+NSK
80 232
11%
http://84.237.85.99:8081/
https://www.gbif.org/
5
6
Владивосток, БСИ ДВО РАН
Иркутск, ИГУ
VBGI
IRKU
46 022
42 154
35%
32%
http://botsad.ru/herbarium/
https://plant.depo.msu.ru/
https://www.gbif.org/
7
Барнаул, АГУ
ALTB
39 905
13%
http://altb.asu.ru/
https://www.gbif.org/
8
9
Екатеринбург, РАН
Кемерово, КузБС РАН
SVER
KUZ
38 873
19 014
30%
34%
https://herbarium.ipae.uran.ru/
https://plant.depo.msu.ru/
https://www.gbif.org/
10 Воронеж, ВГУ
11 Благовещенск, БСИ ДВО РАН
12 Тула, ТулГПУ
VOR
ABGI
TUL
15 456
9 802
9 000
14%
43%
86%
http://herbarium.bio.vsu.ru/
http://botsad.ru/herbarium/
https://plant.depo.msu.ru/
https://www.gbif.org/
Нет в доступе:
IRK – 15 000
(8%)
31.10.2022
74.
Сотни региональных флор, определителей75.
Пять основных «Флор»LE
Район 1
1974-2004
LE
Район 2
2003-[2024?]
NS, NSK
Районы 3,4
1988-2003
VLA
Район 5
1985-2006
TASH
Район 6
1968-1993
76.
Чеклисты С.К. Черепанова (БИН АН СССР)1973
1981
4 745 новых видов и
подвидов, дополняющих
«Флору СССР»
Чеклист №1:
22 238 таксонов
21 463 видов
330 подвидов
445 гибридов
1995
1995
Чеклист №2: 23 397 таксона (два издания: англ., рус.)
21 770 видов, 500 подвидов, 594 гибридов,
533 наиболее обычных культурных вида
77.
Черепанов (1995)78.
Некоторые из «Флор» имеют карты79.
Библиотека «Флора и фауна»• Библиотека
отсканированных
монографий по ботанике и
зоологии
• 16 437 томов
• Основана А.Б. Шипуновым
• Адрес:
http://herba.msu.ru/shipunov
/school/sch-ru.htm
80.
81.
82.
16.09.202183.
84.
2.10.202285.
86.
8.02.202287.
16.09.202188.
Сеточное картирование флоры Владимирской областиFrangula alnus
Серегин, 2012
Серегин, 2014
89.
19.09.202390.
19.09.202391.
Гербарные коллекции: проблемы• Низкая доля оцифровки
• Длительный и затратный процесс
• Сокращение квалифицированных кадров
• Громоздкий процессинг данных
• Сокращение числа обращений к самой коллекции
92.
Данные литературы: проблемы• Низкая доля оцифровки
• Длительный и затратный процесс
• Отсутствие референсных образцов («только название»)
• Большое число обобщающих работ без первичных данных
93.
Данные наблюдений: проблемы• Высокая доля непрофессиональных исследователей
• Данных очень много
• Разное качество фотографий
• Различные диспропорции в данных
94.
Проект «Флора России»на iNaturalist
Цифровой гербарий МГУ
95.
19.09.202396.
Большие данные – большиеошибки
Но их проще искать