Типичные и редкие молекулярно-генетические характеристики опухолевого клона при хроническом лимфолейкозе

1.

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
«Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови
Федерального медико-биологического агентства»
ТИПИЧНЫЕ И РЕДКИЕ МОЛЕКУЛЯРНО - ГЕНЕТИЧЕСКИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКИ ОПУХОЛЕВОГО КЛОНА
ПРИ ХРОНИЧЕСКОМ ЛИМФОЛЕЙКОЗЕ
Дубровина Анастасия Андреевна
лаборатория клеточной и молекулярной иммунологии
«Молекулярная диагностика-2023»
14-16 ноября 2023 г., г. Москва

2.

Вариабельность проявлений хронического лимфолейкоза (ХЛЛ)
Никитин Е.А., Птушкин В.В., Афанасьев Б.В. Хронический лимфолейкоз. Современная
диагностика и лечение. 2023

3.

Клональная эволюция является ключевым моментом
прогрессирования заболевания
F. Bosch, R.Dalla-Favera / Nature Clinical oncology, 2019, V.16

4.

Прогноз заболевания на основе
молекулярно-генетических маркеров
Isabel González-Gascón-y-Marín, Carolina Muñoz-Novas,
Ana-Eugenia Rodríguez-Vicente. Cancers 2021, 13, 1782

5.

Прогностические системы

6.

р53 - статус
del (17р13)
Метод:
FISH
David Gonzalez, Pilar Martinez, Rachel Wade et al. Results From the LRF CLL4 Trial: J Clin Oncol 2011, 29:2223-2229
Alexander J. Cole, Trisha Dwight, Anthony J.Gill Sci. Rep. 6, 26191
мутации
Метод:
секвенирование
(по Сэнгеру)

7.

8.

Мутации в генах иммуноглобулинов (IGHV)
* Соматическая
гипермутация
генов вариабельных
участков
тяжелых цепей
иммуноглобулинов (IGHV)
Метод:
секвенирование по Сэнгеру

9.

Спектр генетических изменений
Методы:
NGS
полногеномное,
экзомное
секвенирование

10.

Дополнительные мутации
Повторяющиеся
NOTCH1, SF3B1, ATM,
BIRC3, POT1, MYD88
уровень ~ 5%
Редкие
BRAF, ZMYM3, IRF4,
NFKB2, XPO1, FBXW7
Larry Mansouri, Birna Thorvaldsdottir,
Lesley-Ann Sutton et al: a study by ERIC in
HARMONY: Leukemia (2023) 37:339 – 347

11.

Стереотипные антигенные рецепторы (САР)
Реаранжировки генов IGHV
CDR3-область
Методы:
аналитические

12.

II РОССИЙСКИЙ НАУЧНОПРАКТИЧЕСКИЙ ФОРУМ
«ЛАБОРАТОРНАЯ
И
ПАТОМОРФОЛОГИЧЕСКАЯ
ДИАГНОСТИКА
ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИХ
ЗАБОЛЕВАНИЙ»
23-24 июня 2023 г., г. Москва

13.

Характеристика пациентов

14.

Анализ p53-статуса у больных хроническим
лимфолейкозом
Методы:
* FISH
Kreatech TP53(17p13)/SE17 FISH
probe (США)
* секвенирование (по Сэнгеру)
экзоны 4-9
Материал - ДНК
Протокол ERIC
Опубликованные данные: Трегубова Е.В., Рыболовлева Т.Н., Назарова Е.Л., Сарпова
М.В. Актуальные вопросы трансфузиологии и онкогематологии. 2022. – с.196-201

15.

Распределение по подтипам заболевания
неопределен
M-ХЛЛ
нМХЛЛ

16.

Представленность генов IGHV и семейств генов
у пациентов
VH1
VH2
VH3
VH4
VH5

17.

Подгруппы стереотипии у пациентов
САР
20,3%
всех случаев ХЛЛ

18.

Делеция Р2514fs*4 (c.7544_7545delCT)
гена NOTCH1
* Схематичная модель гена NOTCH1
75-80% всех мутаций
в гене NOTCH1
Emanuela Rosati et al Front. Oncol. 2018, 8:229

19.

Детекция мутации в гене NOTCH1
- ДНК венозной крови,
костного мозга (ЭДТА)
- Real-time ПЦР
Δct ≤ 7 циклов
пик Tплав.=91ºС

20.

Встречаемость мутации гена NOTCH1
Обнаружена у 13,9% пациентов
ПОДТИП
р=0,01

21.

Сочетание генов IGHV с мутацией гена NOTCH1

22.

Случаи мутаций гена NOTCH1 с определением САР

23.

Выводы
1)
У половины пациентов наблюдаются биаллельные аберрации TP53
2)
Соотношение определения у больных хроническим лимфолейкозом мутированного и
немутированного подтипов составило 1:2
3)
Гены вариабельных участков тяжелых цепей иммуноглобулинов (IGHV) имеют
широкий спектр, каждый подтип заболевания характеризуется своим набором генов и
представленностью семейств генов
4)
Около 20% случаев хронического лимфолейкоза соотносятся со стереотипными
подгруппами
5)
Мутация c.7544_7545delCT в гене NOTCH1 встречается у 13,9% пациентов,
исключительно при немутированном подтипе
6)
Аберрация гена NOTCH1 редко ассоциировалась с генами IGHV семейства VH3
7)
Треть случаев ХЛЛ с мутацией гена NOTCH1 отнесены к подгруппам стереотипии

24.

Заключение
Исследования в области биологии хронического лимфолейкоза
значительно расширили возможность выявлять те группы
пациентов, которые подвержены более высокому риску
прогрессирования заболевания. Перспективными представляются
такие направления, как изучение профилей экспрессии генов,
вовлеченных в подгруппы стереотипного В-клеточного рецептора,
описание их эпигенетических модификаций. Эти новые знания
лежат в основе новых алгоритмов лечения для клинического
ведения пациентов с хроническим лимфолейкозом.

25.

Авторы:
Трегубова Е.В., Назарова Е.Л.
Осипова Е.С.
Благодарность:
сотрудникам
лаборатории прикладной иммуногенетики,
лаборатории патоморфологии
ФГБУН КНИИГиПК ФМБА России
Дубровина Анастасия Андреевна
м.н.с. лаборатории клеточной и
молекулярной иммунологии
ФГБУН КНИИГиПК ФМБА России
[email protected]