Систематика прокариот

1.

Систематика прокариот

2.

Таксон — группа организмов, обладающих заданной
степенью однородности.
Для характеристики микроорганизмов используют
разнообразные признаки: морфологические,
цитологические, культуральные, физиологические,
биохимические, иммунологические и др. Если объем
информации для характеристики объектов по существу
беспределен, то для целей идентификации может быть
использован ограниченный объем информации,
достаточный для распределения организмов по
таксономическим группам.

3.

Специальный раздел таксономии — номенклатура —
имеет дело с правилами присвоения наименований
описанным объектам. В систематике бактерий для
наименования объекта используют биномиальную
номенклатуру К. Линнея (К. Linne, 1707—1778), согласно
которой биологическому виду присваивают название,
состоящее из двух слов: первое определяет
принадлежность организма к определенному роду,
второе — виду. Названия бактериям присваивают в
соответствии с правилами Международного кодекса
номенклатуры бактерий.

4.

Основной таксономической категорией является
вид. Отнесение прокариотных организмов к
одному или разным видам осуществляется в
большой степени эмпирическим путем на основе
анализа многих признаков, при этом генетическая
информация, содержащаяся в нехромосомных
генетических элементах, для определения
видовой принадлежности не используется.
В микробиологии употребляются такие термины,
как "штамм" и "клон". Под штаммом понимают
бактериальные культуры одного вида,
выделенные, например, из разных мест обитания.
Различия между штаммами не выходят за
пределы вида. Клон — еще более узкое понятие,
это культура, выделенная из одной клетки.

5.

• Накопление огромного фактического материала потребовало
классифицировать изучаемые в микробиологии объекты для удобства
работы с ними. В современной классификации микроорганизмов
принята следующая иерархия таксонов: Домен, Царство
(Regnum),Отдел (Phylum),Класс (Classis),Порядок (Ordo),Семейство
(Familia),Род (Genus),Вид (Species). Микробиологи пользуются
биномиальной системой обозначения объекта (номенклатуры),
включающее родовое и видовое названия, например Escherichia coli.
• «Жизнь» разделяется на домены:
Архебактерии - особая экологическая группа бактерий, обычно
обитающих в весьма экзотичных условиях (экстремальные
термофилы, экстремальные галлофилы и тд.).
Домен эубактерии включает большинство современных «истинных»
бактерий.
Эукариоты - одно- и многоклеточные ядерные организмы,
относящиеся к царствам животных (Animalia), растений (Plantae) и
грибов (Fungi).

6.

Категория 1 Gracilicutes
Организмы с разной
морфологией,
имеющие
грамотрицательную
клеточную стенку.
Размножение в основном
бинарным делением, в
некоторых группах –
почкованием, в одной –
множественным
делением.
Спор не образуют.
Многие подвижны: с
помощью жгутиков или
скольжения.
Аэробные, аназробные
или факультативно
аназробные формы.
Отдел подразделяется на
3 класса,
объединяющие
нефотосинтезирующие
(Scotobacteria) и
фотосинтезирующие
(Anoxyphotobacteria,
Oxyphotobacteria)
организмы
Категория 2 Firmicutes
Организмы с
грамположительной
клеточной стенкой.
Размножаются в
основном бинарным
делением. Некоторые
образуют зндоспоры. У
других споры на гифах
или в спорангиях.
Перемещаются с
помощью жгутиков.
Большинство
неподвижны. В состав
отдела входят
азробные, анаэробные,
факультативно
анаэробные формы. В
зависимости от
морфологии
предложено деление на
2 класса: Firmibacteria
(кокки, палочки,
неветвящиеся нити) и
Thallobacteria
(ветвящиеся формы)
Категория 3 Tenericutes Категория 4 Mendosicutes
Относятся прокариоты, у
которых отсутствует
клеточная стенка и не
синтезируются
предшественники
пептидогликана. Клетки
окружены ЦПМ,
чрезвычайно
плеоморфны.
Размножение бинарным
делением, почкованием,
фрагментацией.
Окрашивание по Граму
отрицательное.
Характерно образование
мелких, врастающих в
агар колоний. Могут
быть сапрофитами,
паразитами или
патогенами.
Представлены одним
классом Mollicutes
Объединены прокариоты,
по имеющимся данным,
претендующие на более
раннее происхождение,
чем формы, включенные
в 1 и 11 отделы. Клетки
разной формы: кокки,
палочки, нити. Многие
плеоморфны.
Большинство имеют
клеточную стенку, но она
не содержит типичного
пептидогликана.
Клеточная стенка может
быть построена только из
белковых макромолекул
или
гетерополисахаридов.
Окрашивание по Граму
отрицательное или
положительное.
Большинство – строгие
аназробы. Многие имеют
жгутики.
Характеризуются
экологическим и
метаболическим
разнообразием,
способностью жить в
экстремальных условиях.
Объединены в класс
Archaeobacteria

7.

Группы внутри четырех основных категорий бактерий (с. 21)
Категория 1
1. Спирохеты (с. 30)
2. Аэробные/микроаэрофильные, подвижные, спиральные/изогнутые грамотрицательные бактерии (с. 42)
3. Неодвижные (или, редко, подвижные) грамотрицательные изогнутые бактерии (с. 67)
4. Грамотрицательные, аэробные/микроаэрофильные палочки и кокки (с. 73)
5. Факультативно анаэробные грамотрицательные палочки (с. 180)
6. Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые и спиральные бактерии (с. 295)
7. Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серы (с. 337)
8. Анаэробные грамотрицательные кокки (с. 348)
9. Риккетсии и хламидии (с. 352)
10. Аноксигенные фототрофные бактерии (с. 353)
11. Оксигенные фототрофные бактерии (с. 375)
12. Аэробные хемолитотрофные бактерии и родственные организмы (с. 437)
13. Почкующиеся и/или обладающие выростами бактерии (с. 467)
14. Бактерии, обладающие чехлом (с. 487)
15. Нефотосинтезирующие, не образующие плодовых тел скользящие бактерии (с. 493)
16. Скользящие бактерии, образующие плодовые тела: миксобактерии (с. 523)
Категория 2
17. Грамположительные кокки (с. 536)
18. Грамположительные палочки и кокки, образующие эндоспоры (с. 567)
19. Грамположительные неспорообразующие палочки правильной формы (с. 573)
20. Грамположительные неспорообразующие палочки неправильной формы (с. 579)
21. Микобактерии (с. 606)
22-29. Актиномицеты (с. 613)
22. Нокардиоформные актиномицеты (с. 630)
23. Роды с многогнездными спорангиями (с. 655)
24. Актинопланы (с. 658)
25. Стрептомицеты и близкие роды (с. 672)
26. Мадуромицеты (с. 683)
27. Thermomonospora и близкие роды (с. 699)
28. Термоактиномицеты (с. 704)
29. Другие роды (с. 706)

8.

Категория 3
30. Микоплазмы (или молликуты): бактерии без клеточной стенки
Категория 4
31. Метаногены
32. Сульфатредуцирующие археи
33. Экстремально галофильные аэробные архебактерии (галобактерии)
34. Архебактерии, лишенные клеточной стенки
35. Экстремальные термофилы и гипертермофилы, метаболизирующие
S0
Хотя клетки архебактерий структурно относятся к прокариотному типу,
они построены из макромолекул (липидов, полисахаридов, белков),
многие из которых являются уникальными и не синтезируются ни
эукариотами, ни эубактериями. Архебактерии осуществляют ряд
биохимических процессов, не свойственных остальным живым
организмам.
Представленная в Определителе бактерий Берги система
классификации является строго идентификационной и не решает
задачи выявления эволюционных связей между прокариотами.