Классические методы секвенирования. Анализ данных, полученных в ходе секвенирования

1.

Лекция 4
Классические методы секвенирования.
Анализ данных, полученных в ходе секвенирования.

2. История

• Метод Сэнгера был предложен Фредериком
Сэнгером в 1977 году, за который он был
удостоен нобелевской премии по химии в
1980 году.
• В том же году Максам и Гилберт предложили
альтернативный метод, получивший название
«метод химической деградации».
• Технологии NGS были предложены уже в XXI
веке

3. Примеры секвенирования

A C G T
Метод Максама Гилберта
Метод Сэнгера

4. Флюорофоры наше всё! :)

5. Флюорофоры наше всё! :)

6. Как же это все происходит?

7. Как все это выглядит

Классическое и желательное распределение уровня светимости флюорофоров

8.

Нежелательное распределение уровня светимости
флюорофоров
Примесь ингибиторов
Мало материала

9.

Дешифровка и матрица подвижностей

10.

Характерные случаи

11.

Наложение пиков друг на друга

12.

Квазиштамм

13.

Повторы в геноме

14.

Истинная гетерозигота

15. Визуализаторы

• FinchTV (бесплатный)
• Sequencher (платный)
• TraceEditor (встроен в пакет Mega начиная с
5 версии)

16. FinchTV

17. Sequencher

18. TraceEditor